液相探针捕获检测产品
液相探针捕获检测是在溶液中,基于核酸分子碱基互补杂交原理实现目标片段DNA富集,而后使用高通量测序技术检测分析的一套整体解决方案。
首先针对目标区域设计特异探针;其次在溶液中目标DNA片段和带有生物素标记的探针直接杂交,继而通过生物素亲和素的反应使目标DNA片段锚定在带有亲和素的微珠上;然后洗去非目标DNA片段,对富集的DNA进行扩增,最后使用高通量测序仪测序并分析。
Figure 2 液相探针捕获检测流程
技术优势:适用于任何物种,已知或未知位点的鉴定;
无严格标记数量限制,最佳适用标记数量1K-200K;
定制和后续检测没有样本数的限制,无需凑板;
升级灵活,可随时添加新的位点,或者低成本进行不同panel的叠加组合;
现有产品及应用范围:
- 玉米48K panel:包含玉米染色体均匀分布的48,000个位点,检测周期约1个月,适用DNA指纹图谱鉴定、种质资源分析、QTL定位、GWAS、全基因组选择、标记辅助育种等等;
DNA要求:精提DNA,无杂质污染无降解,OD260/OD280在1.8~2.0之间;浓度大约1ug/uL,需要20uL。
- 定制化的液相捕获panel开发:承接各种作物的液相捕获定制化panel开发,开发周期约4个月。开发后的产品适用于DNA指纹图谱鉴定、种质资源分析、QTL定位、GWAS、全基因组选择、标记辅助育种等等目标。
需提供明确的位点序列信息、基因组版本、重测序数据等。
DNA要求:
1)50毫克DNA样本1份,用于封闭试剂的制备,使用新鲜叶片普通提取方法即可,浓度为1ug/uL,体积50毫升,可以混合相同作物不同品种进行提取。提取时间较长,需要在项目早期着手准备。
2)测试用的DNA样本10份:精提DNA,无杂质污染无降解,OD260/OD280在1.8~2.0之间;浓度大约1ug/uL,需要20uL。